Hydration of Phosphate Ion in Polarizable Water: Effect of Temperature and Concentration

نویسندگان

چکیده

The hydration of phosphate ions, an essential component many biological molecules, is studied using all-atom molecular dynamics (MD) simulation and quantum chemical methods. MD simulations are carried out by employing a mean-field polarizable water model. A good linear correlation between the self-diffusion coefficient anion concentration ascertained from computed mean-square displacement (MSD) profiles. HB evaluated time-dependent autocorrelation function CHB(t) determined to be slightly faster for phosphate–anion system as compared that water–water at room temperature. coordination number (CN) ion found 15.9 298 K with 0.05 M concentration. average CN also calculated 15.6 same non-equilibrium simulation, namely, well-tempered meta-dynamics method. full geometry optimization PO43−·16H2O cluster investigated ωB97X-D/aug-cc-pVTZ level theory, observed have both singly doubly bonded anion–water hydrogen bonds inter-water in range 0.169–0.201 nm 0.192–0.215 nm, respectively. Modified Stokes–Einstein relation used calculate conductivity agreement experimentally value.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Chloride Ion Hydration and Diffusion in Supercritical Water Using a Polarizable Water Model

Masahito Kubo,† Ronald M. Levy,*,‡ Peter J. Rossky,§ Nobuyuki Matubayasi,| and Masaru Nakahara*,| Department of Chemistry and Chemical Biology, Rutgers, The State UniVersity of New Jersey, Piscataway, New Jersey 08854-8087, Institute for Theoretical Chemistry, Department of Chemistry and Biochemistry, UniVersity of Texas at Austin, Austin, Texas 78712, and Institute for Chemical Research, Kyoto...

متن کامل

: the effect of sericin levels (silk glue protein) on rate of in vitro maturation, fertilization and culture of sheep oocytes

هدف از آزمایش اول بررسی اثر سطوح مختلف سریسین [0 (control), 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 %] افزوده شده به محیط , ivm بر cumulus cell expansion، بلوغ هسته و توسعه متوالی جنین، در گوسفندان نژاد سنجابی در فصل تولید مثلی می باشد. از سرگیری میوز به وسیله خارج شدن اولین پولار بادی اندازه گیری و هم چنین درصد رسیدن جنین های دو سلولی به مرحله کلیواژ و بلاستوسیت نیز به عنوان نشانه ای از میزان شایستگی توسعه اولیه ج...

fabrication of new ion sensitive field effect transistors (isfet) based on modification of junction-fet for analysis of hydronium, potassium and hydrazinium ions

a novel and ultra low cost isfet electrode and measurement system was designed for isfet application and detection of hydronium, hydrazinium and potassium ions. also, a measuring setup containing appropriate circuits, suitable analyzer (advantech board), de noise reduction elements, cooling system and pc was used for controlling the isfet electrode and various characteristic measurements. the t...

effect of seed priming and irrigation regimes on yield,yield components and quality of safflowers cultivars

این مطالعه در سال 1386-87 در آزمایشگاه و مزرعه پژوهشی دانشگاه صنعتی اصفهان به منظور تعیین مناسب ترین تیمار بذری و ارزیابی اثر پرایمینگ بر روی سه رقم گلرنگ تحت سه رژیم آبیاری انجام گرفت. برخی از مطالعات اثرات سودمند پرایمینگ بذر را بر روی گیاهان مختلف بررسی کرده اند اما در حال حاضر اطلاعات کمی در مورد خصوصیات مربوط به جوانه زنی، مراحل نموی، عملکرد و خصوصیات کمی و کیفی بذور تیمار شده ژنوتیپ های م...

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Liquids

سال: 2023

ISSN: ['2673-8015']

DOI: https://doi.org/10.3390/liquids3030018